에이즈는 바이러스에 의해 유발된다. 만일 항문성교로 인해hiv에 감염되었다면, 그 상대방은 또 다른 사람에게 동일한 방법으로 감염시 킬 수 있다. 일반적으로 정액을 받는 사람은 항문성교시에 직장이 약화되고 병원균의 침입을 받기 쉽게 되기 때문에 hiv에 감염될 위험이 더 크다. 그러나 감염될 상대방 안으로자신의 음경을 들이미는 사람 역시 hiv가 음경을 통해 인체로 침입할 수 있기 때문에 위험할 수 있다.
그럼에도불구하고 항문성교를 하려면, 반드시 고무콘돔을 사용하라. 콘돔은 hiv 감염을 예방하는 데 효과적이다. 콘돔이 찢어지면 이것은잘못 사용했기 때문이다. 보통 콘돔은 정상적인 질을 통해 섹스에 비해 항문성교 시에 더 잘 찢어진다. 항문성교를 할 때는 콘돔을사용한다 해도 위험할 수 있다. 그러나 만일 수용성 윤활제를 사용할 경우라면, 찢어질 가능성이 작아진다.
만일 상대방이 hiv 감염자라면, 질이나 항문 혹은 오랄 섹스보다는 다른 에로틱한 행동들을 고려해야 할 것이다. hiv를 갖고 있는 혈액이나 정액, 질 분비물이 바이러스를 전염시킬 수 있다는 사실을 명심해야 한다.